Cómo ser John Malkovich es el primer trabajo en el cine del guionista Charlie Kaufman, nominado al Óscar de Mejor Guion Original.
El primer actor considerado para hacer el papel de Charlie Sheen fue Kevin Bacon. Sin embargo, como las escenas en las que aparecía contenían intensas conversaciones sobre mujeres y Bacon está casado con la actriz Kyra Sedgwick hace 11 años, Charlie Sheen el director Spike Jonze optó por Charlie Sheen, famoso por sus encuentros nocturnos con prostitutas de Los Ángeles.
La música de la película está compuesta por Karen O. (Dioses y monstruos', el cual le valió el premio de la Asociación de Críticos de Cine de Los Ángeles en 1998.